Копирование кода:
Для начала научимся переносить код на сервер. Я полагаю что у вас уже есть репозитарий на GitHub, в котором вы работаете.
Поэтому генерируем ключи на сервере:
ssh-keygen
Оставляем все по умолчанию. Потом копируем ключ:
cat /root/.ssh/id_rsa.pub
И добавляем его в список разрешенных ключей в своем профиле GitHub:
Settings -> SSH and GPG Keys -> New SSH key
Не забудем скопировать ссылку на клонирование репозитория:
Your Repositories -> -> Code -> Local -> SSH
Идем в консоли сервера в каталог, где будет жить бот и клонируем код проекта: